Shida ya kutoweka kwa wanyama wengine sio mahali pa mwisho katika nadharia ya mageuzi na ina umuhimu mkubwa katika mafundisho ya Darwin. Idadi ya spishi zinazoishi kwa wakati huu zinachukua tu sehemu isiyo na maana ya idadi ya wanyama ambao wamewahi kutokea kwenye sayari (chini ya 1%). Jamii 99% hatimaye zimekufa, na kuna sababu nyingi za hii.
Wanaohusika zaidi na kutoweka ni wanyama wanaopatikana katika sehemu moja au zaidi katika maeneo yenye kijiografia. Ikiwa safu yote imepata shughuli za kibinadamu, basi spishi zinazoishi ndani yake zinaweza kutoweka. Sababu ya moja kwa moja ya kutoweka kwa aina zingine za wanyama katika hali ya asili ni kupungua kwa idadi yao chini ya kiwango muhimu, kilichowekwa na sheria za maumbile ya idadi ya watu. Muhimu ni kiwango cha wingi, chini ya hapo uwezekano wa kuvuka karibu sana inakuwa kubwa, ambayo inasababisha kupungua kwa utofauti wa maumbile ya spishi. Kama matokeo, kuna idadi ya watoto walio na shida ya kuzaliwa ambayo huongeza vifo katika vizazi vipya. Mimea ambayo imeundwa kama matokeo ya idadi moja au zaidi ya watu pia inaweza kuangamizwa haraka. Jamii yoyote inaweza kutoweka kama matokeo ya moto, matetemeko ya ardhi, magonjwa na shughuli za wanadamu. Jamii zilizo na idadi tofauti ya watu hazina uwezekano wa kupotea. Ikilinganishwa na ndogo, wanyama wakubwa wana maeneo makubwa ya mtu binafsi. Wanahitaji chakula kingi, na mara nyingi huwa mawindo kwa wanadamu. Wanyama wakubwa hushambuliwa zaidi, sio tu kwa sababu ni mawindo, lakini pia kwa sababu wanashindana na wanadamu katika uwindaji wa wanyama, wakati mwingine hushambulia watu na mifugo. Kuna idadi ya wanyama ambao hula katika maeneo makubwa. Wao pia wanakabiliwa na kutoweka, mradi sehemu ya safu yao imeharibiwa. Pamoja na ukuaji wa asili wa maumbile, mabadiliko ya mazingira hulazimisha vikundi vingine kuzoea hali mpya. Wanyama ambao hawawezi kuzoea wanalazimika kuhamia kwenye makazi yanayofaa. Vinginevyo, spishi zao zinatishiwa kutoweka. Kasi ya haraka ya ukuzaji wa maliasili inashinda mabadiliko, ikiacha uhamiaji kama chaguo pekee. Jamii ya wanyama ambao hawawezi kuvuka mashamba, barabara na makazi mengine yanayosumbuliwa wamepotea. Utumiaji wa haki daima imekuwa sharti la kutoweka kwa spishi za wanyama wenye thamani kubwa. Unyonyaji kupita kiasi unaweza kupunguza sana idadi ya watu. Ikiwa uwindaji haujasimamiwa na sheria, basi aina fulani za wanyama zinaweza kuwa karibu kutoweka.
